(Ei) tavallinen epäilty lepakosta peräisin oleva uusi koronavirus

A tuoreessa tutkimuksessa tunnistetaan Ishayoiden opettaman uusi koronavirus, joka on vastuussa keuhkokuumepidemiasta Hubein maakunnassa Kiinassa- lepakosta peräisin oleva virus liittyy muihin tunnettuihin patogeenisiin koronaviruksiin

- 2019 uusi koronavirus (CoV) aiheuttaa kuolemaan johtavan keuhkokuumeen, joka on vaatinut yli 1300 ihmishenkiä, ja yli 52000 vahvistettua tartuntatapausta 13. helmikuuta 2020, kaikki hieman yli kuukauden ajan. Mutta mikä tämä virus on? Onko se kokonaan uusi virus? Mistä se tuli? Kiinan huippututkimuslaitosten tutkijat ryhtyivät vastaamaan näihin kysymyksiin, ja tämä uraauurtava tutkimus on julkaistu vuonna Kiinan lääketieteellinen lehti.

https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs

Joulukuun alussa muutamat ihmiset Wuhanin kaupungissa Hubein maakunnassa Kiinassa alkoivat sairastua käydessään paikallisilla äyriäismarkkinoilla. He kokivat oireita, kuten yskää, kuumetta ja hengenahdistusta, ja jopa komplikaatioita, jotka liittyvät akuuttiin hengitysvaikeusoireyhtymään (ARDS). Välitön diagnoosi oli keuhkokuume, mutta tarkkaa syytä ei voitu selittää. Mikä aiheutti uuden taudinpurkauksen? Onko se vaikea akuutti hengitystieoireyhtymä (SARS) -CoV? Onko se Lähi-idän hengitysoireyhtymä (MERS) -CoV? Kuten käy ilmi, tutkijat olivat tehneet joulukuussa tutkimuksen tämän viruksen tunnistamiseksi ensimmäisten tapausten analysoinnin jälkeen. Tämä tutkimus on nyt julkaistu Kiinan lääketieteellinen lehti ja viruksen henkilöllisyys on todettu - se on täysin uusi virus, joka liittyy läheisesti lepakoiden SARS-tyyppiseen CoV: hen. Tutkimuksen johtava tutkija Jianwei Wang (Kiinan lääketieteen akatemia, Patogeenibiologian instituutti) sanoo:Asiakirjamme on selvittänyt tähän mennessä tuntemattoman lepakosta peräisin olevan CoV: n identiteetin."

Tässä tutkimuksessa tutkijat Kiinan tunnetuista tutkimuslaitoksista, kuten Kiinan lääketieteellisen akatemian, patogeenibiologian instituutin, Kiinan ja Japanin ystävyyssairaalan ja Pekingin unionin lääketieteellisen korkeakoulun, löysivät ja tunnistivat yhdessä uuden CoV: n - pääasiallisen syyllisen Wuhanin taudinpurkaus - seuraavan sukupolven sekvensoinnilla (NGS). He keskittyivät viiteen potilaaseen, jotka otettiin Wuhanin Jin Yin-tan -sairaalaan ja joista suurin osa oli työntekijöitä Wuanin Huanan Seafood Market -markkinoilla. Näillä potilailla oli korkea kuume, yskä ja muut oireet, ja heillä diagnosoitiin aluksi keuhkokuume, mutta syystä ei tiedetä. Joidenkin potilaiden tila huononi nopeasti ARDS: ksi; yksi jopa kuoli. Tohtori Wang sanoo:Potilaiden rintakehän röntgenkuvat osoittivat joitakin sumeita samentumia ja konsolidoitumisia, jotka ovat tyypillisiä keuhkokuumeelle. Halusimme kuitenkin selvittää, mikä aiheutti keuhkokuumeen, ja myöhemmät kokeemme paljastivat tarkan syyn— Uusi CoV, jota ei aiemmin tunnettu."

Tutkimuksessa tutkijat käyttivät potilaista otettuja keuhkoputken alveolaarihuuhtelunäytteitä (BAL) (BAL on menettely, jossa steriili neste siirretään keuhkoihin bronkoskoopin kautta ja kerätään sitten analyysiä varten).

Ensinnäkin tutkijat yrittivät tunnistaa viruksen genomin sekvensoinnilla NGS-tekniikkaa käyttäen. NGS on suositeltava seulontamenetelmä tuntemattomien patogeenien tunnistamiseksi, koska se havaitsee ja sulkee pois kaikki tunnetut patogeeniset mikro-organismit näytteessä. BAL-nestenäytteiden DNA / RNA: n sekvensoinnin perusteella tutkijat havaitsivat, että suurin osa viruksen lukemista kuului CoV-perheeseen. Sitten tutkijat koottivat erilaiset "lukut", jotka kuuluivat CoV: iin, ja rakensivat uuden genomin koko genomisen sekvenssin; nämä sekvenssit olivat 99.8-99.9% samanlaiset kaikkien potilaiden näytteiden välillä, mikä vahvisti, että tämä virus oli yleinen taudinaiheuttaja kaikilla potilailla. Lisäksi homologianalyysin avulla, jossa verrataan genomisekvenssiä muihin tunnettuihin genomisekvensseihin (ennalta asetetulla 90 prosentin kynnyksellä, jotta sitä voidaan pitää "uudena" sekvenssinä), he vahvistivat, että tämän uuden viruksen genomisekvenssi on 79.0% samanlainen kuin SARS-CoV, noin 51.8% samanlainen kuin MERS-CoV ja noin 87.6–87.7% samanlainen kuin muiden kiinalaisten hevosenkengän lepakoiden (nimeltään ZC45 ja ZXC21) SARS: n kaltaiset CoV: t. Fylogeneettinen analyysi osoitti, että saatujen viiden CoV-kannan sekvenssit olivat lähinnä lepakosta peräisin olevien kantojen sekvenssejä, mutta muodostivat erilliset evoluutiohaarat. Nämä havainnot viittaavat selvästi siihen, että virus on peräisin lepakoista. Tohtori Wang toteaa,Koska viruksen replikaasigeenin samankaltaisuudet kaikkien muiden tunnettujen "samankaltaisten" virusten kanssa ovat edelleen alle 90%, ja ottaen huomioon myös filogeneettisen analyysin tulokset, katsomme, että tämä on todellakin uusi, aiemmin tuntematon CoV. Tätä uutta virusta kutsutaan väliaikaisesti vuodeksi 2019-ncov."

Lopuksi tutkijat siirtyivät "eristämään" viruksen BAL-nestenäytteistä tarkistamalla, osoittivatko nestenäytteet sytopaattista vaikutusta solulinjoihin laboratoriossa. Nestenäytteille altistuneet solut havaittiin elektronimikroskoopilla, ja tutkijat löysivät tyypillisiä CoV: n kaltaisia ​​rakenteita. He käyttivät myös immunofluoresenssia - tekniikkaa, jossa käytetään spesifisiä vasta-aineita, jotka on merkitty fluoresoivilla väriaineilla. Tätä varten he käyttivät toipuvien potilaiden seerumia (joka sisälsi vasta-aineita), joka reagoi solujen sisällä olevien virushiukkasten kanssa; tämä vahvisti, että tämä virus oli todellakin tartunnan syy.

Tämä tutkimus tasoittaa tietä tuleville tutkimuksille ymmärtääksesi viruksen ja sen lähteet paremmin, erityisesti kun otetaan huomioon sen nopea leviäminen, kyky aiheuttaa kuolemaan johtavaa ARDS: ää ja taudinpurkauksen aiheuttama paniikki. Vaikka neljä viidestä potilaasta, joilta tämä virus tunnistettiin, olivat Wuhanin äyriäismarkkinoilta, infektion tarkkaa alkuperää ei tunneta. CoV olisi voitu välittää ihmisille "välituotteen" kantajan kautta, kuten SARS-CoV: n (kämmenen sipuliliha) tai MERS-CoV: n (kameli) tapauksessa. Tohtori Wang päättelee:Kaikki ihmisen CoV: t ovat zoonoottisia, ja useat ihmisen CoV: t ovat peräisin lepakoista, mukaan lukien SARS- ja MERS-CoV: t. Tutkimuksemme osoittaa selvästi kiireellisen tarpeen säännöllisesti seurata lepakosta peräisin olevien CoV: n leviämistä ihmisille. Tämän viruksen ilmaantuminen on massiivinen uhka kansanterveydelle, ja siksi on erittäin tärkeää ymmärtää viruksen lähde ja päättää seuraavista vaiheista ennen kuin voimme nähdä laajemman taudinpurkauksen"