Caris Life Sciences® esittelee havaintoja, jotka antavat syvemmän ymmärryksen siitä, että geenien kasvaimen ilmentyminen, joka liittyy lääkealtistuksen laajuuteen, jaoteltuna p53-statuksen mukaan, liittyy kliinisiin tuloksiin yleisissä kemoterapeuttisissa hoito-ohjelmissa, joita käytetään metastaattisen paksusuolensyövän (CRC) hoitoon. Nämä tulokset esitellään vuoden 2022 American Association for Cancer Researchin (AACR) vuosikokouksessa, joka pidetään 8.–13 New Orleansissa, Louisianassa.
Wafik El-Deiry johti tutkimusta, jonka otsikko oli "Prognostiset ja ennustavat lääkkeiden aiheuttamat geenitunnisteet paksusuolen ja peräsuolen syöpäpotilaille, jotka on yksilöity p53-tilan ja FOLFOX-, 5-FU-, oksaliplatiini- tai irinotekaanihoidon perusteella" (tiivistelmä #1231). , MD, Ph.D., FACP, Brownin yliopiston Legorreta Cancer Centerin johtaja, Warren Alpert Medical Schoolin apulaisdekaani, Carisin Precision Oncology Alliancen (POA) jäsen. Carisin POA on kasvava johtavien syöpäkeskusten verkosto ympäri maailmaa, jotka tekevät yhteistyötä tarkkuusonkologian ja biomarkkereihin perustuvan tutkimuksen edistämiseksi. Tätä työtä esittelee New Orleansissa Lindsey Carlsen, patobiologian jatko-opiskelija Brownin EL-DEIRY-laboratoriosta.
Tämän tutkimuksen tavoitteena oli tunnistaa ennustavat biomarkkerit CRC:ssä käytettäville kemoterapioille. Tutkimuksessa käytettiin CRC-solulinjoja eri tavoin ilmentyneiden geenien tunnistamiseen 5-fluorourasiili-, irinotekaani- tai oksaliplatiinihoidon jälkeen ja osoitti allekirjoitukset p53-tilan perusteella. Näistä in vitro -tutkimuksista tutkijat tutkivat sitten, voisivatko nämä geenit ja geenien allekirjoitukset ennustaa CRC-potilaiden tuloksia kemoterapian jälkeen (FOLFOX, 5-fluorourasiili, irinotekaani tai oksaliplatiini). 2,983 6,229 villityypin ja 53 XNUMX toiminnan menettäneen pXNUMX CRC -potilaan näytettä analysoitiin seuraavan sukupolven DNA/RNA-sekvensoinnilla Caris Life Sciencesissa. Reaalimaailman selviytymistulokset pääteltiin vakuutuskorvaustiedoista ja Kaplan-Meier-arvioista. Sekä prognostisella että ei-prognostisella geeniekspressiolla oli merkittävä vaikutus eloonjäämistuloksiin spesifisten lääkehoitojen jälkeen.
"Tämä tutkimus auttaa meitä ymmärtämään geenien allekirjoitusten tärkeyden osoittamaan parannettua ennustuskykyä yksittäisiin transkripteihin verrattuna", El-Deiry sanoi. "Tämä tutkimus yhdistää perustutkimuksen ja kliinisen tutkimuksen ja antaa meille mahdollisuuden ymmärtää paremmin, mitkä hoidot hyödyttävät todennäköisemmin CRC-potilaita." Tutkimuksessa havaittiin, että lääkkeille altistumiseen liittyvien geenien kasvaimen ilmentyminen voi ennustaa tuloksia kemoterapiahoidon jälkeen:
• Korkea EGR1- ja FOS-mRNA ennustavat itsenäisesti vasteen FOLFOXille potilailla, joilla on villityypin p53-kasvaimet.
• Matala CCNB1-mRNA korreloi hyvän ennusteen kanssa CRC-potilailla, joilla on kasvaimia, joissa on TP53:n toimintahäiriömutaatioita.
• BTG2:n alhainen ilmentyminen ennustaa parempaa ennustetta potilailla, joilla on MSI-High TP53 -mutatoituneita kasvaimia.
• Geenien allekirjoitukset voivat osoittaa parantuneen ennustuskyvyn verrattuna yksittäisiin transkriptiovaikutuksiin.
"Caris on keskittynyt biomarkkereihin, jotka voivat ennustaa potilaan vasteen uusimpiin hoitoihin, mutta myös kokeiltuihin ja todellisiin kemoterapioihin, kuten FOLFOX", sanoi W. Michael Korn, MD, Chief Medical Officer Carisista. "Olemme innoissamme nähdessämme translaation tutkimuskyvyn, joka perustuu valtavaan multi-omic dataan ja analyyttisiin työkaluihin, joita Caris on kehittänyt ja jatkaa edistymistä."
Carisin kattava molekyyliprofilointi arvioi koko eksomin (DNA), koko transkription (RNA) ja proteiinin ilmentymisen, mikä tarjoaa vertaansa vailla olevan resurssin ja ihanteellisen tien eteenpäin translaatiotutkimuksen suorittamiseen nopeuttaakseen löytöjä havaitsemista, diagnoosia, seurantaa, hoidon valintaa ja lääkekehitystä varten. parantamaan ihmisen tilaa.
Caris esittelee lisätietoa tutkimuksista, jotka osoittavat täsmälääketieteen ja molekyyliprofiloinnin kriittisen roolin syövän hoidossa. Kaikki esitykset ovat saatavilla verkossa Cariksen verkkosivujen kautta 8 alkaen.
Lisäesitykset paljastavat kattavan molekyyliprofiilin vaikutuksen ja mahdollisen kliinisen toimivuuden
• FGF/FGFR-muutosten kattava karakterisointi invasiivisissa rintasyövissä (Abstract #5793) FGFR-signalointi on keskeistä syöpäsolujen lisääntymiselle, migraatiolle, angiogeneesille ja eloonjäämiselle; FGFR-muutoksista on tullut kliinisesti vaikuttavia yhä useammissa syöpätyypeissä. Tässä tutkimuksessa arvioitiin lukuisten FGF/FGFR-muutosten ilmaantuvuus ja karakterisointi yli 12,000 XNUMX invasiivisessa rintasyövässä ja korostettiin FGF/FGFR-muutosten valtavaa heterogeenisuutta eri histologisissa ja molekyylisissa alatyypeissä sekä rintasyövän erilaisissa metastaattisissa kohdissa. Lisäksi FGFR-muutosten ja terapiaresistenssin yhteydet osoitettiin suuressa kliinisessä tietokannassa vastaavilla molekyylituloksilla.
• EGFR-alatyyppien genomiset ja immuuniominaisuudet ei-pienisoluisessa keuhkosyövässä (NSCLC) (Abstract #4119) Vaikka EGFR-mutantti-NSCLC-kasvaimet ovat yleensä resistenttejä PD-1/PD-L1-estäjille, pienellä potilaiden osajoukolla voi olla kestävä vaste . EGFR-mutanttikasvaimet osoittavat merkittävää molekyylien heterogeenisyyttä, mutta EGFR-mutaatioiden alatyyppien genomi- ja immuuniprofiileista ei ole selvyyttä, ja tämän lisäselvitys voi auttaa tunnistamaan potilaita, jotka todennäköisesti reagoivat immuunipohjaisiin hoitoihin. Tämä tutkimus hyödyntää DNA:n ja RNA:n seuraavan sukupolven sekvensoinnin tuottamaa multi-omic-molekyylidataa suurella NSCLC-kasvainten ryhmällä ja vahvistaa useimpiin EGFR-mutaatioiden alatyyppeihin liittyvän vähentyneen immunogeenisyyden, joka ilmenee biomarkkereista, mukaan lukien PD-L1, TMB ja CD8+ T. solujen tunkeutuminen; ja paljastaa harvinaisia EGFR-mutaatioita, jotka liittyvät suotuisaan immuuniprofiiliin ja jotka voivat viitata immuunihoitoon.
